“353”三步走发展战略：第一步，到2007年，基本完成学科建设、培养模式、办学层次、管理体制的结构性调整，逐步扩大本科办学规模，完成教育观念由专科办学向本科办学的转变，将学校建设成为一所多学科、教学型的本科院校；第二步，2008-2012年，在巩固、深化、提高、发展的基础上，继续提高办学水平，突出办学特色，基本实现专业教育本科化，形成良性发展态势，力争在教育部本科教学工作评估时保良争优，并积极开展研究生教育，将学校发展成为综合性、教学型的本科高校；第三步，2013-2015年，办学水平在省内同类院校中达到领先地位，建立一批省内知名学科和优势专业，努力实现建设综合性、教学科研型菏泽大学的宏伟目标。
　　三个紧紧依靠：紧紧依靠党委、政府和社会各界的大力支持；紧紧依靠广大教职员工的艰苦努力；紧紧依靠改革开放。
　　六大转变：一是由专科教育观念向本科教育观念转变；二是由以师范教育为主向多科性、综合性教育转变；三是由以普通教育为主向普通教育、职业教育、成人教育并举转变；四是由以面向地方办学向面向山东、走向全国转变；五是由以教学为主向教学科研并重方向转变；六是由国家办学向多种成份办学转变，走合作办学、股份办学、开放办学的路子。
　　“十一五”规划目标:立足菏泽，面向山东,走向全国，服务于区域经济社会发展，实现专科教育向本科教育的实质转变，到2010年，把我校建成在省内外有一定影响的普通本科高校。
　　“十一五”期间学校要完成的主要任务(摘要)：
　　办学规模：在保证办学质量的基础上，继续稳步扩大办学规模，到2010年，使全日制本专科在校生人数达到 2万人，其中本科生占三分之二以上，各种继续教育和培训生人数达到2万人。
　　教育结构：大力发展本科教育，继续搞好专科教育，巩固发展成人教育，办好高等职业技术教育。形成普通教育、成人教育和职业技术教育协调发展的教育体系。
　　学科专业设置：每年新增6-8个本科专业，到2010年本科专业达到51个。建设5个省级品牌专业、特色专业和示范性专业；建成3个具有鲜明地方特色并在省内外有一定影响的重点学科（实验室）。
　　课程建设与人才培养：建设省级以上精品课程5门，校级优质课程50门。加强实践环节教学和动手能力培养，提高学生的社会适应力和竞争力，使毕业生一次就业率保持省内同类院校领先水平。
　　科学研究：力争建成一家自主开发高新技术产品的校办企业；建立30个重点研发基地；争取30项省级以上立项课题；取得30项省级以上鉴定成果和奖励，力争获得国家级科研奖励，取得1-2项在省内外具有较大影响的标志性成果；核心期刊论文数量占论文总量30%以上，其中被国际三大索引数据库收录100篇以上；出版学术专著不低于30部；专利申请年均增幅不低于30%，其中发明专利不少于50%；进一步加大科研投入，科研经费年均增长30%以上，其中横向课题研究经费占总量的 20%以上；科技成果转化率达到30%，在科技创收方面实现新的突破；加强学术交流，学校每年要有计划地开展学术交流活动；加强《菏泽学院学报》建设，办好“水浒”文化专栏，进一步提高质量和扩大影响。
　　师资队伍建设：到2010年在编教工中高职比达到40%，高学历师资的比例达到40%以上。培养省级教学名师、省级基础学科中青年带头人、省级青年骨干教师重点培养对象等30名在省内外有一定影响的教学和科研骨干。
　　教学仪器设备：按照省高校实验室建设评估标准，搞好与本科教学、科研相适应的实验室建设，加强多媒体教室和公共实验室建设，确保2010年生均多媒体教室座位和语音教室座位数、计算机台数等硬件达到教育部评估验收标准。加速校园网络建设，不断完善和扩大服务功能，使其达到省级评估验收良好以上标准。
　　图书资料建设：到 2010年，图书馆纸质图书藏书要达到 130万册，阅览座位 5000个，期刊8000种。
　　基础设施建设：完成建筑面积1万平方米的理工楼、3.6万平方米的学生公寓楼和1500余户教工住宅小区建设；力争2010年前完成28万余平方米的二期工程建设任务，使学校占地面积达到1620亩，建筑面积达到70万平方米。
　　校园文化建设：通过对大学精神文化、制度文化、行为文化、环境文化的建设，大力弘扬科学精神与人文精神，美化校园环境、浓厚学术氛围，形成优良学风、教风和校风，建设现代、文明、高雅、和谐、充满朝气和活力的校园文化。
　　对外交流与合作：加强与国内外院校多渠道、多形式、多层次的交流与合作，实现在校培养研究生“零”的突破，为硕士点的申报打下基础，实现与国外联合办学“零”的突破；认真开展和落实联合办学项目，逐步建立起以项目为主、具有实质内容的交流与合作模式，充分利用国内外教育资源加强学术、科技交流；实现留学生教育“零”的突破；不断增加外籍教师人数，基本满足教学需要。
　　菏泽学院 “二期工程”：根据菏泽市和菏泽学院“十一五”发展规划，决定进行菏泽学院二期工程规划建设。二期工程在校本部现有的基础上往东、西、北分别扩至牡丹路、解放大街和长城路，二期规划用地面积 1072.5亩，工程建设完成后，校本部总占地面积1742.1亩，容纳在校生23500人。
　　三为本：以本科为本，以学生为本，以质量为本。
　　本科教学工作评估：本科教学工作评价由教育部统一领导，根据教育部或原国家教委颁发的 《普通高等学校本科教学工作评价方案》进行。评价内容包括指导思想、师资队伍、教学条件与利用、教学建设与改革、教学管理、学风、教学效果7项一级指标，此外，要求有特色项目。评价结论由教育部审定，并以适当的方式对外公布。评估结论分为优秀、良好、合格、不合格四种，是学校增设本科专业，新增硕士、博士学位授权单位及其学位授权学科、专业点等有关工作资格审查的依据之一。本科教学工作未达合格的学校，区别情况，令其限期整顿、停止招生或撤消学士学位授权单位资格。
　　六个不发生：不发生群体性事件，不发生群死群伤的安全责任事故，不发生大规模的食物中毒事故，不发生大的火灾和房屋倒塌事故，不发生大的治安刑事案件，不发生“法轮功”非法聚集事件。（编辑部）