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到2002年，农大108播种面积达4000万亩，已成为全国粮食作物中年种植面积最大的玉米品种。
科技进步二等奖：
旱地农业保护性耕作技术与机具研究（工学院，高焕文，主持）猪优质高效饲料产业化关键技术研究与推广（动科学院，李德发，主持）2003!!技术发明奖二等奖：
猪高产仔数FSHβ基因发现及其应用研究（生物学院，李宁，主持）科技进步二等奖：
黄淮海平原持续高效农业综合技术研究与示范（资环学院，郝晋珉，主持）2004!!科技进步二等奖：
梅花鹿、马鹿高效养殖增值技术（动科学院，冯仰廉，参与）2005!!自然科学奖二等奖：
提高作物养分资源利用效率的根际调控机理研究（资环学院，张福锁，主持）这一项目创建了VA菌丝际养分动态和植物根分泌物活化养分能力的定量化等一系列根际研究新方法。这些方法已成为国际同行广泛采用的经典方法。在方法创新的基础上，研究发现缺铁缺锌都能诱导禾本科植物分泌铁载体，而铁载体能高效活化铁、锌、铜等元素；发现VA菌根真菌可使作物吸收土壤磷的范围扩大60倍，菌丝具有酸化和分泌酸性磷酸酶的作用，对植物吸磷的贡献潜力高达70%。这一发现揭示了菌丝际养分活化的机理，将根际研究深入到菌丝际水平；发现根际互作是间套作体系养分高效利用的关键过程，禾本科与豆科作物间作使豆科作物结瘤固氮能力提高了近2倍，为高产高投入体系仍能充分利用共生固氮菌的生物学潜力提供了科学依据，也为研究作物生态系统地下生物相互作用机理提供了新模式，为挖掘利用间套作等我国传统农业之精髓提供了新的理论指导。
通过研究使科研人员认识到植物利用土壤养分的生物学潜力巨大。推动了植物营养学的发展，丰富和完善了根际营养理论，为认识和调控植物-土壤关系、实现养分资源的高效利用提供了理论依据，并将为中国农业走出一条作物高产、资源高效和环境保护并重的可持续发展之路提供理论指导。
科技进步二等奖：
优质玉米自交系综3和综31的选育与利用（农学院，戴景瑞，主持）新型秸秆揉切机系列产品的研制与开发（工学院，韩鲁佳，主持）2006!!技术发明二等奖：
高油玉米种质资源与生产技术系统创新（农学院，宋同明，主持）玉米芯酶法制备低聚木糖（食品学院，李里特，主持）科技进步二等奖：
动物性食品中药物残留及化学污染物检测关键技术与试剂盒产业化（动医学院，沈建忠，主持）微生物农药发酵新技术新工艺及重要产品规模应用（农学院，宋渊，参与）荒漠化发生规律及其综合防治模式研究（资环学院，李保国，参与）2007!!科技进步二等奖：
棉花化学控制栽培技术体系的建立与应用（农学院，李召虎，主持）精准农业关键技术研究与示范 （信电学院，汪懋华，参与）益生制剂及其增效技术研究与应用（动科学院，计成，参与）工厂化农业（园艺）关键技术研究与示范（水院，马承伟，参与）花卉新品种选育及商品化栽培关键技术研究与示范（农学院，赵梁军，参与）2008!!科技进步二等奖：
猪健康养殖的营养调控技术研究与示范推广（动科学院，李德发，主持）协调作物高产和环境保护的养分资源综合管理技术研究与应用（资环学院，张福锁，主持）防治重大抗性害虫多分子靶标杀虫剂的研究开发与应用（农学院，高希武，参与）名优花卉矮化分子、生理、细胞学调控机制与微型化生产技术（农学院，段留生，参与）2009!!技术发明奖二等奖：
鸡分子标记技术的发展及其育种应用（生物学院，李宁，主持）科技进步二等奖：
北方一年两熟区小麦免耕播种关键技术与装备（工学院，李洪文，主持）商品包装、储运安全关键技术研究与应用（食品学院，罗云波，参与）都市型设施园艺栽培模式创新及关键技术研究与示范推广（农学院，赵冰，参与）吉林玉米丰产高效技术体系（农学院，刘慧涛，参与）粮食保质干燥与储运减损增效技术开发（工学院，李栋，参与）南方蔬菜生产清洁化关键技术研究与应用（农学院，刘西莉，参与）2010!!科技进步一等奖：
矮败小麦及其高效育种方法的创建与应用（农学院，孙其信，参与）科技进步二等奖：
牛和猪体细胞克隆研究及应用 （生物学院，李宁，主持）农业化学节水调控关键技术与系列新产品产业化开发及应用（水院，杨培岭，主持）主要作物种子健康保护及良种包衣增产关键技术研究与应用（农学院，刘西莉，主持）芽孢杆菌生物杀菌剂的研制与应用（农学院，王琦，主持）青藏高原牦牛乳深加工技术研究与产品开发（食品学院，任发政，主持）干旱半干旱农牧交错区保护性耕作关键技术与装备的开发和应用（工学院，张学敏，参与）2011!!科技进步二等奖：
肉鸡健康养殖的营养调控与饲料高效利用技术（动科学院，呙于明，主持）嗜热真菌耐热木聚糖酶的产业化关键技术及应用（食品学院，李里特，主持）有机固体废弃物资源化与能源化综合利用系列技术及应用（资环学院，李国学，参与）冬小麦节水高产新品种选育方法及育成品种（农学院，王志敏，参与）2012!!科技进步一等奖：
中国小麦条锈病菌源基地综合治理技术体系的构建与应用（农学院，马占鸿，参与）技术发明奖二等奖：
基于胺鲜酯的玉米大豆新调节剂研制与应用（农学院，段留生，主持）科技进步二等奖：
苹果矮化砧木新品种选育与应用及砧木铁高效机理研究（农学院，韩振海，主持）都市型现代农业高效用水原理与集成技术研究（水院，杨培岭，参与）猪鸡病原细菌耐药性研究及其在安全高效新兽药研制中的应用（水院，曹薇、李保明，参与）优质乳生产的奶牛营养调控与规范化饲养关键技术及应用（动科学院，杨红建、李胜利，参与）P3和P4实验室生物安全技术与应用（动医学院，赵德明，参与）畜禽粪便沼气处理清洁发展机制方法学和技术开发与应用（水院，董仁杰，参与）
