第三次“双代会”上的校长工作报告，是在深入调研，广泛听取广大师生意见，充分发扬“党委领导、校长负责、教授治校、民主管理”的基础上形成的。报告近万字，凝聚了学校党政领导班子的大量心血，集中体现了全校师生的集体智慧，反映了全校师生的共同心愿。报告通篇贯彻了中央关于树立科学发展观、构建和谐社会等一系列战略指导思想，同时结合我校实际，提出了学校工作重心“三个转移”、努力做好“三篇文章”的方针。现在我们将其报告要点摘录如下：
　　一）报告回顾06年工作时，肯定成绩、实事求是。报告在前面回顾06年工作的基础上，总结出了八方面取得显著成效的工作。包括：本科教学评建工作扎实推进、教学水平进一步提高、科研与学术交流工作进一步强化、学科建设水平进一步提升、人才强校战略成效显著、内部管理体制更具活力、国际合作更加广泛和富有成效、党建和思政工作进一步加强。
　　二）报告提到学校发展中存在的不足和问题。校长工作报告中在总结成绩的同时，也清醒地看到，学校在快速发展过程中，还存在不少的困难和问题。主要表现在：一是重大的科研项目和成果还很少；二是高层次人才，特别是领军水平人才还较缺乏；三是超大规模的多校区管理还有待进一步加强。
　　三）报告提出2007年学校工作的总体要求：
　　继续坚持以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，全面贯彻落实科学发展观，积极推进工作重心从外延发展转移到内涵建设上来，从以数量扩张转移到进一步提高质量上来，从以教学为主转移到教学与科研并重上来的“三个转移”，认真做好管理、质量、特色“三篇文章”，不断提升学校核心竞争力，促进学校各项事业又好又快地发展，努力创建高水平的新型综合性大学。
　　四）07年学校工作思路之一：
　　“加强管理，创新体制机制，优化资源配置，规范办学行为”。
　　具体表现在：一是要树立现代管理理念，大力开展“管理年”活动；二是要建立和健全现代大学制度；三是要加强财务和资产管理；四是要进一步深化后勤管理体制改革；五是要强化附属、直属医院的建设与管理；六是学校其他各项工作也要按照学校工作总体要求，严格管理，整体推进，协调发展。
　　五）07年学校工作思路之二：狠抓质量，深化教学改革，抓好评估整改，提高办学声誉
　　一是要全面启动质量工程建设。二是要切实做好本科教学评估的整改工作。三是要进一步完善素质教育课程体系，将素质教育核心课程列为通识课程，进行重点建设。四是要进一步提高研究生的培养质量。五是要进一步提高生源质量和毕业生就业率。六是要切实提高继续教育质量。七是要积极推进国际化进程。
　　六）07年学校工作思路之三：突出特色，构筑人才高地，服务江西崛起，提高办学效益。
　　一是要实施“文理工医渗透、学研产相结合”的办学思路。二是大力推进研究型大学建设。三是要实施“高层次创造性人才计划”。四是要切实加强科研基地建设。五是要进一步实施省高校哲学社会科学领军人才和科研学术骨干培养计划。
　　七）07年学校工作思路之四：加强党建和思想政治工作，弘扬昌大精神，凝聚全校师生，构建和谐校园。
　　一是要继续推进民主政治建设。二是要进一步加强各级组织和领导班子的思想政治建设。三是要继续抓好党风廉政建设和反腐败工作。四是要加强宣传思想工作。五是要加强大学生思想政治教育。六是要加强安全稳定工作。
　　八）校长工作报告的其观点和立论是在国内外高等教育发展趋势、我校自身资源和发展现状以及高等教育发展规律的基础上提出的。工作思路既有对既往政策的延续，又有根据新情况新局面做出的创新。报告具有很强的针对性、指导性。