“十二五”科技创新战略
我校“十二五”期间将实施重大项目带动工程。凝练科研主攻方向，做好重大项目储备工作，以承担国家“973”计划、“863”计划、国家自然科学基金重点项目、国家社会科学基金重点项目、杰出青年基金项目、国家科技支撑计划和行业重大科技专项为着力点，力争实现科研项目、层次的重大突破。汇聚整合学科力量，积极开展对国家和区域产业结构优化升级起重大带动作用的共性技术、关键技术和配套技术的攻关研究，不断提高科技创新能力，形成一批有学术影响力和社会影响力、拥有自主知识产权的标志性成果。通过高端引领，带动我校科学研究整体水平的提升。
　　我校“十二五”期间将实施创新平台建设工程。围绕国家、行业和地方重大战略需要，瞄准科学前沿，注重学科交叉，借助社会资源，采取多种方式，与国家有关部委、省市政府、大中型企业、国内外著名高校和科研机构开展合作，加快省部级重点实验室、工程研究中心的建设。以高校服务海西建设重点项目、中央财政支持地方高校发展专项资金、福建省高校优势学科创新平台项目为依托，提升各类工程技术研究中心和实验室建设的层次和效益。
　　我校“十二五”期间将实施创新团队建设工程。以学科发展为导向，以学科带头人和学术骨干为核心，整合科研力量，遴选和培育一批队伍结构合理、业务水平较高、学术思想活跃、发展态势良好的创新团队和优秀群体，树团队品牌，创团队特色。
　　
“十二五”开放办学战略
我校“十二五”期间将实施国际合作交流工程。拓宽邀请国际知名学者来我校做学术报告、访学、合作研究的渠道；加大教师海外进修、访学支持力度。鼓励教师走上国际学术舞台，参加或举办高层次国际学术会议，提高教师国际学术对话能力。拓展中外合作、联合培养学生、交换在校生等项目，拓宽学生的国际视野；适度提升外籍教师的数量和比例；增加外国留学生数量。积极开展国际文化交流；创办陈爱礼国际学院，提升中外合作办学层次。
　　我校“十二五”期间将实施台港澳合作交流工程。发挥航海、轮机学科的优势，在船员培养和船员考证方面与台湾进行实质性的合作，为台湾船员取得STCW78/95公约要求的适任证书提供支持。发挥学校闽南传统体育、闽南文化研究特色，加强与台湾地区高校文化交流合作。利用“先行先试”的有利政策，积极主动与台港澳高校开展互派教师、互换学生、共建平台、合作研究、联办学术会议等多种形式的交流合作。有计划地聘请台港澳专家学者来校任教、合作研究，选派专家学者赴台港澳访学、研究。加大对台港澳招生工作力度，吸引更多台港澳优质生源来校学习。