2011年9月第八次党代会以来，学校党委团结带领全校各级党组织、全体党员和广大师生员工，抢抓机遇，深化改革，求真务实，攻坚克难，推动南开办学实力稳步增强，社会影响持续扩大，各项事业都取得了新的进步。
　　贯彻落实党的教育方针，把牢社会主义办学方向
　　认真落实党和国家重大决策部署。深入学习贯彻党的十八大和十八届三中、四中、五中、六中全会精神，深刻领会党中央治国理政新理念新思想新战略，自觉向以习近平同志为核心的党中央看齐。坚持抓大事、谋全局，把中央关于教育、科技、人才工作的重大决策部署贯彻落实到学校工作各领域各环节。制定实施“十二五”规划，编制综合改革方案，启动“争创一流、统筹建设”计划，凝炼发展战略，落实重点任务，着力推动改革发展。
　　坚持把立德树人作为根本任务。在全国高校率先制定素质教育实施纲要，推进“公能”特色素质教育。突出思想政治教育在人才培养中的重要地位，把培育践行社会主义核心价值观融入教书育人全过程。深入推动马克思主义中国化最新成果的“三进”工作，首批进入全国重点马克思主义学院建设。坚持党对意识形态工作的领导权，规范课堂教学、讲座论坛和网络管理，妥善处理了若干意识形态敏感问题。
　　推进中国特色现代大学制度建设。坚持和完善党委领导下的校长负责制，发挥党委总揽全局、协调各方的领导核心作用，支持校长独立负责开展工作。推动完善内部治理结构和制度体系，制定《南开大学章程》，修订党委会、校长办公会议事规则和“三重一大”决策制度实施办法，完善学术委员会工作机制，启动筹建南开大学理事会，完成修订专业学院工作细则。强化民主参与和民主监督，多渠道发挥教代会、学代会、研代会的重要作用，通过教师大会、校务公报、校长信箱、校领导接待日等形式扩大校务公开，师生员工和校友了解校情、表达诉求的渠道更加畅通。
　　弘扬南开“公能”文化。积极探索社会主义核心价值观的南开表达，精心培育校园文化品牌，3次获得全国高校校园文化建设特等奖。加强社会主义精神文明建设，蓬勃开展丰富多彩的创建活动，引导广大师生员工爱国敬业、诚信友善、崇德上进。校友工作得到全面加强，发展筹资工作进展明显，面向建校百年的校史编研宣教工作全面展开，南开校训、校歌的影响不断扩大。
　　突出质量特色主题，各项改革和事业发展加速推进
　　以“立公增能”为核心的教育教学改革取得新进展。大力推动办学观念、教育内容、培养模式的“三个转变”，先后召开教学、德育、体育、美育工作会议，努力做实四育融合的“公能”素质教育。实施夏季学期改革，教改试验全面推进，“拔尖创新人才”培养计划延伸到文科专业。新增一批国家精品课程、国家教学成果奖和国家实验教学示范中心。实施研究生培养机制改革，优化培养结构和培养方案。构建学生素质发展辅学支持体系，“公能”素质评估全面推行。加强招生和就业工作，生源质量稳步提升，精准化就业服务体系逐步完善。加强创新创业教育，强化社会实践育人效果，涌现出以“闯先生”为代表的一批优秀典型。
　　以“百人计划”为引领的人才工作取得新进展。探索完善百名高端人才支持计划、百名青年学科带头人培养计划、百名后备师资培养计划和教师国际化支持计划，引育新增院士、长江学者、国家千人、国家万人计划领军人才、国家杰青、国家优青、国家青年千人等一批高层次人才，教师队伍的学历、学缘、学科和年龄结构进一步优化。不断深化人事制度改革，实施模拟绩效工资，试点建设“人才特区”，强化教师发展培训，加强师德学风建设。
　　以“优化整合”为基调的学科建设取得新进展。确定“建高原、起高峰、收缩握拳式发展”战略，通过学科调整，形成文、社、理、工、医等门类综合发展的新布局。推动落实“分层建设、绩效调节”的学科发展新机制，20个学科进入全国高校前10名。推进现代工学体系建设，组建电子信息与光学工程学院、计算机与控制工程学院、材料科学与工程学院，推动软件学院开展校企协同培养。整建制接收天津市第四医院，为加快医学学科发展创造条件。加强应用社会科学发展，组建金融学院，商学院通过国际认证，法学院成为国家卓越法律人才教育培养基地。
　　以“需求和前沿”为导向的科学研究取得新进展。确定面向国家战略需求和世界学术前沿的科研方针，实施哲学社科繁荣计划、科技创新奖励计划。重大科研平台建设取得进展，牵头或参与3个得到国家认证的“2011协同创新中心”，新增两个教育部国际联合实验室、科技部国际科技合作基地和一批国家科技重大专项、国家重点基础研究发展计划项目，药物化学生物学国家重点实验室建设扎实推进。重要科研成果不断涌现，获得国家自然科学二等奖两项，在全球自然指数排行中名列中国高校前茅，自然科学“表现不俗”论文比例、承担国家社科基金重大项目等位居全国高校前列。
　　以“知中国服务中国”为宗旨的社会服务取得新进展。智库建设成效明显，组建当代中国问题研究院、生态文明研究院等一批机构，APEC研究中心、经济与社会发展研究院、滨海开发研究院等推出的一大批高水平研究成果，在党和政府决策中发挥了积极作用。产学研协同持续加强，成立了科技成果转化中心、津南研究院、国家新材料研究院等机构，服务社会的能力显著提升。创新发展继续教育和远程教育，为地方政府和企事业单位的人才培养作出贡献。扎实作好对口支援喀什大学和延边大学，定点扶贫甘肃省庄浪县，产生了积极社会影响。
　　以“全球南开”为目标的海外交流合作取得新进展。国际化办学水平不断提升，实施“留学南开”计划，增加全英文授课项目，组建南开-格拉斯哥大学联合研究生院。海外交流深度拓展，承担公立大学校长论坛秘书处工作，积极参与达沃斯论坛、国际大学联盟，师生员工境外交流超过8200人次，接待海外来访7100余人次，举办高层次国际会议活动100多场。新建3所孔子学院，培训对外汉语教师近2000人次，成为国家跨文化交流研究与培训基地，多次获得国家表彰。开展“全球南开”大讨论，实施了重心下移的外事工作改革。
　　紧抓历史发展机遇，“一校三区”办学格局初步形成
　　津南校区建成启用。经过艰苦不懈的努力，完成新校区一期工程建设，全校教学科研面积增长89%，有效缓解了困扰多年的发展瓶颈问题。在规划建设过程中，严格制度规范，努力打造廉洁、绿色、安全工程。在新校区启用过程中，坚持师生为本、保障运转，顺利完成了历史性的搬迁。在“一校三区”格局形成后，努力探索津南校区顺畅运行的工作模式。依照保护、建好老校区的思路，调整八里台校区整修规划。积极推动泰达校区向国际合作、校企协同和高端科研创新的方向发展。
　　办学条件明显改善。办学经费收入累计127.3亿元，比“十一五”期间增长61.4%，银行贷款基本还清，净资产增长96%，教职工收入明显提高。公房管理使用得到规范。校园网升级改造和业务系统建设深入推进，建成大型仪器设备共享平台，图书文献对教学科研的支撑保障作用显著增强。加强实验室安全和消防安全整治，构建校园技防体系，维护了校园总体和谐稳定。
　　管理服务水平不断提升。深化管理体制创新，整合成立后勤保障部，设立国有资产管理委员会，推行“全口径”国有资产管理。实施内部控制规范建设，开展制度文件“废改立”工作，初步完成以清产核资和企业改制为重点的产业规范化建设。强化精简高效、以人为本的管理服务导向，开展作风建设年活动，坚持每年办好服务师生员工的20件实事，在两个校区同步设立师生服务中心，实施家属区提升改造、青年教工周转房改革等民生项目。
　　落实管党治党责任，党的建设工作全面加强
　　领导班子建设进一步加强。扎实开展党的群众路线教育实践活动、“三严三实”专题教育和“两学一做”学习教育。校领导班子坚持中心组学习制度，坚定理想信念，强化“四个意识”，每年召开专题民主生活会，主动开展批评与自我批评，主动查摆问题、整改落实。先后制定了加强班子自身建设和改进工作作风的意见等文件。自觉坚持党委领导下的校长负责制，认真执行民主集中制，党政团结，合作补台，共同担当。健全完善统战工作机制，坚持与民主党派和无党派人士肝胆相照、合作共事。
　　基层组织建设进一步加强。坚持优化结构、提高质量，五年发展党员9260名，党员日常教育管理和监督得到加强。分党校工作机制全面建立，校院两级党校教育培训体系得到完善。修订支部工作细则和支部工作手册，完善支部建制，配强支部班子。依托“创最佳党日”“支部结对共建”等活动，深化学习型、服务型、创新型党组织建设，探索推进基层党建工作述职评议。300个基层党组织、272人次获得校级以上表彰。
　　干部队伍建设进一步加强。修订干部选拔任用、后备干部队伍建设等制度，出台取消实体研究机构行政级别、设立聘任制中层岗位等办法，实施干部任免过程记实、党委常委会无记名票决等措施，加大了公开选拔和竞争上岗力度，选人用人的规范化得到加强。继续拓展干部境内外培训渠道，着力加强中层干部管理监督，中层班子和中层干部考核评价机制在实践中进一步完善。
　　党风廉政建设进一步加强。制定落实“两个责任”实施办法，不断夯实党委主体责任和纪委监督责任。认真贯彻中央八项规定精神，通过自查自纠、专项整治，坚决反对和抵制“四风”。公务接待、公车使用、因公出国等管理制度全面改进。开展党风廉政专项督查，分步推进廉政风险防控机制建设，强化对招生录取、基建工程、招标采购等重点领域权力运行的制约和监督。积极推动落实党风廉政建设责任制和领导干部“一岗双责”，进一步加强领导干部经济责任审计。采取一系列措施深化党章党规党纪的教育，严肃查处了一批违规违纪案件。