药学院创建于战火纷飞的解放战争之中，由原第三军医大学成都军医学院药学教研室、药理学教研室、中医药学教研室、化学教研室合并而组建，是四川省乃之西部地区具有较强影响的药学专业院系之一。
　　药学院现为 TheConsor鄄tiumforGlobalizationofChineseMedicine会员单位、中国医药教育协会高等药学院校（院）委员会单位、四川省药理学会常务理事单位、四川省色谱协会委员会理事单位、四川省生理协会委员会理事单位、四川省生物医药平台—分析测试平台和四川省成都科技应用创新服务平台资源单位，与美国戴安、瑞士步琪两公司合作建立西南地区示范实验室。
　　药学院现有药学和药物制剂两个专业，囊括研究生、本科生和专科生三个层次人才的培养，同时大力发展药学高等教育自学考试教育；其中，药学专业为四川省高等本科特色专业。学院建有1个省级实验教学示范中心，1个国家中医药管理局二级科研实验室，1个校级药物研究所和1个省级高校重点实验室。
　　药学院下设教务科、学生科和研究生科3个职能科室，下属化学、药理学、药物分析、药剂学、药物化学、生药学及实验教学中心等7个教研室，主要承担2个专业的专业基础课、专业课、专业选修课及全校的公共基础课等58门，是我院专业建设、学科建设及人才培养的中坚力量。药学院拥有一支学历层次高、学科布局合理、专业能力强、职称结构好的师资队伍。
　　全院共有教职员工 60人（含人事代理），专职教师49人，教授6人，副教授24人，留学归国人员6人，高级职称占专职教师的比例为61.2%；博士28人，硕士16人，博士占专职教师的比例为57.1%。药学院已先后培养军地毕业生3000余名，目前在校生1396人，药学本科总共18个班次、药学专科7个班次、药剂学专业4个班次，辅导员队伍实行人性化和个体化学生管理模式。学院根据药学高素质应用型人才培养要求，重基础强实践并与企业联合培养，毕业学生素质得到用人单位一致好评。
　　药学院重视学科凝练、科研突破与技术服务，学院共承担科技部重大新药创制项目3项，国家自然科学基金8项，省部级及厅级局50余项，横向新药研究项目10余项，科研经费总计逾700万元。发表SCI及核心期刊文章326篇，国家发明专利33项，出版教材及专著12部，各类各级科技进步奖10项。