1976年10月，党中央一举粉碎 “四人帮”，“十年浩劫”宣告结束。熬过严冬，春临大地，山东农学院师生欣喜若狂，加倍努力工作，力争挽回“文化大革命”给学校造成的损失。这一时期，山东农学院和全国高等院校一样，经历了从混乱、徘徊到逐步建立起正常的教学、工作秩序，进入稳步发展时期。
　　1975年，王成旺同志调任山东农学院党委书记兼革委会主任，主持学院全面工作。王成旺在山东农学院工作期间，正值党和国家经历调整整顿、拨乱反正和改革开放三个关键时期，他怀着对党的事业的无限忠诚，以扎实的理论功底、丰富的工作经验、善于驾驭全局的工作能力和高超的工作艺术，带领全院师生经受了国家形势由乱到治巨大历史变革的严峻考验，冲破阻力，全面落实党的知识分子政策，学院各项工作快速恢复和发展。
　　虽然 “文化大革命”结束了，但是历次政治运动造成的冤假错案，就像一道道紧箍咒，压得知识分子喘不过气来。许多知识分子被错误地定为右派、反革命分子、反动学术权威，甚至被抄家。为了解决历史遗留问题，学校组成专门工作班子，集中力量对在反右、文化大革命等政治运动中受到审查迫害的三百余名教职工和毕业生逐一进行复查，对全部冤假错案给予了彻底平反，打碎了长期桎梏人们心头的枷锁，教职工的工作积极性空前高涨，教学、科研、管理等各项工作呈现出勃勃生机。
　　1983年9月，经山东省政府批准，山东农学院更名为山东农业大学。其时，学校设农学、林学、植保、农经等八个系和社科、基础两个教学部，教职工1440人，各类在校生2206人。为进一步提高教学质量，学校深入进行实践教学探索，形成了具有鲜明特色的四年一贯制的实践教学体系，以农学系为代表创立的“三段式”人才培养模式，受到农业部和国家教委的重视。在此基础上，由杨景林等主持完成的“实行教学、科研、生产三结合，建立适应经济建设需要的教学体制”成果获国家级教学成果特等奖。1991年，国家教委、农业部、林业部在山东农业大学召开了全国高等农林教育改革座谈会，国家教委党组书记、副主任何东昌，国家教委副主任朱开轩、王明达，农业部副部长洪绂曾，山东省副省长宋法棠与会。会议对山东农业大学的“三段培养”模式和学校工作给予了充分肯定和高度评价。
　　“文革”结束后，中央于1978年召开了全国科学大会，余松烈教授参加会议并获科学大会奖。为加强科研工作，学校制定了八项措施，成立了科研处和遗传育种、栽培生理两个研究所以及果树栽培、植物病毒等7个研究室。这个时期，各类各级学会得到了很大发展。1978年山东农学会在山东省科技教育界率先恢复活动，并由陈瑞泰、方国玺、李家文教授担任该会副理事长。之后，由山东农大部分教授作为主要发起人，相继成立了山东遗传学会、山东植物生理学会等 5个学会，学校有5位教授分别当选为这5个学会的理事长。截至1989年，山东农大教师中在全国性学会担任副理事长的有3人，常务理事8人，在省级学会担任理事长的6人，副理事长30人。这从一个侧面反映了学校教师队伍的学术水平。
　　随着改革开放的不断深入和学校社会声誉的提高，学校的国际学术交流和交往活动日渐增多。1980年，经国家教委、外交部批准，学校与美国肯塔基大学农学院建立了校际交流关系。1982年该院院长巴恩哈特博士率团来学校访问并签订了人员及资料等方面相互交流的协议书。至1991年，学校派往该学院攻读博士学位的研究生有13人，访问学者13人。这个时期，学校向14个国家派出攻读硕士、博士学位研究生共49人，访问学者及进修人员53人。对外交往的开展，不仅提高了学校的知名度，而且对学校的教学、科研及师资培养都起到了积极的促进作用。